Para ilmuwan memiliki ketertarikan besar terhadap Phobos untuk memecahkan teka-teki evolusi Mars. Hingga saat ini, asal-usul satelit ini masih menjadi perdebatan panjang di kalangan astronom dunia.
Ada dua teori utama yang ingin dibuktikan melalui misi khusus ini:
Teori tabrakan besar yang melepaskan material dari Mars hingga membentuk satelit tersebut.
Teori penangkapan asteroid yang kemudian terjebak dalam gravitasi planet Mars.